En 1917, Charles Muller fonde son commerce de machines-outils à Bévilard dans le Jura. Essentiellement liée à l'industrie horlogère, l'entreprise se déplace à Bienne en 1929. La crise horlogère des années 30 l'a amenée à diversifier ses secteurs d'activités : elle touche aujourd'hui tous les secteurs industriels.Félix, Serge et Marcel succèdent à leur père en 1942 et créent la société anonyme actuelle. En 1966, l'entreprise construit son premier entrepôt sur le site actuel avec une surface au sol de 1'400 m².A la mort de Félix Muller, en 1967, son fils Michel rejoint la Direction. En 1983, Muller Machines SA ouvre à Brügg/Bienne un des plus grands centres européens de machines-outils d'occasion, avec une exposition permanente de 12'000 m².